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Analyse génétique indienne du « nouveau » coronavirus
Auteurs :Prashant Pradhan, Ashutosh Kumar Pandey, Akhilesh Mishra, Parul Gupta1, Praveen Kumar Tripathi, Manoj Balakrishnan Menon, James Gomes, Perumal Vivekanandan and Bishwajit Kundu
Contribution égale :
1Kusuma School of biological sciences, Indian institute of technology, New Delhi-110016, India.
2Acharya Narendra Dev College, University of Delhi, New Delhi-110019, India
Correspondants : bkundu@bioschool.iitd.ac.in et vperumal@bioschool.iitd.ac.in
Résumé
Nous assistons actuellement à une épidémie majeure causée par le nouveau coronavirus 2019 (2019-nCoV). L'évolution du coronavirus 2019-nCoV ne s’explique pas. Nous avons trouvé 4 sites d’insertion dans la glycoprotéine de pointe (S) qui sont uniques au 2019-nCoV et ne sont pas présents dans d'autres coronavirus. Il est important de noter que les résidus d'acides aminés dans les 4 sites d’insertion ont une identité ou une similitude avec ceux de la gpl20 du VIH-1 ou du Gag du VIH-1. Fait intéressant, bien que les sites d’insertion soient discontinus sur la séquence d'acides aminés primaire, la modélisation 3D du 2019-nCoV suggère qu'ils convergent pour constituer le site de liaison du récepteur. La découverte de 4 sites d’insertion uniques dans le coronavirus 2019-nCoV, qui ont tous une identité / similitude avec les résidus d'acides aminés dans les protéines structurales clés du VIH-1, a peu de probabilité d’apparaître par hasard dans la nature. Ce travail fournit des informations encore inconnues sur 2019-nCoV et met en lumière l'évolution et la pathogénicité de ce virus avec des implications importantes pour le diagnostic de ce virus.
PDF de l'article scientifique en anglais
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Pierre 03/02/2020 13:15